Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE1Q96RT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTAGE1Q96RT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTAGE1Q96RT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE1Q96RT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE1Q96RT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE1Q96RT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE1Q96RT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms