Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms