Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3IPQ96QF0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms