Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms