Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms