Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC138Q96M89 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms