Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms