Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALML4Q96GE6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms