Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4CQ96DT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4CQ96DT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms