Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP7Q93009 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP7Q93009 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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