Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRAT1Q92837 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms