Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP205Q92621 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms