Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms