Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms