Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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