Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms