Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC112Q8NEF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC112Q8NEF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms