Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTR1Q8N1G2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms