Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00518Q8N0U6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00518Q8N0U6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms