Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms