Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms