Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms