Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms