Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HRCT1Q6UXD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms