Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms