Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBRD2Q68DH5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms