Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRB2Q5IJ48 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRB2Q5IJ48 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms