Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALFQ53S48 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALFQ53S48 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms