Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms