Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms