Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB8Q3ZCM7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms