Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms