Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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