Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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PCSK7Q16549 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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