Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEBPEQ15744 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEBPEQ15744 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms