Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRADDQ15628 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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