Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms