Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms