Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
R3HDM1Q15032 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HDM1Q15032 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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