Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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GBX1Q14549 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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GBX1Q14549 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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GBX1Q14549 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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