Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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