Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKD2Q13563 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKD2Q13563 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
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