Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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