Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms