Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms