Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YMR221CYMR221C 1515 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 CTK1YKL139W 1587 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 BNA6YFR047C 888 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 PCL7YIL050W 858 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YKL162CYKL162C 1209 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 KTR2YKR061W 1278 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YMR130WYMR130W 909 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 MCK1YNL307C 1128 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 UAF30YOR295W 687 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 LAS21YJL062W 2493 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RAD1YPL022W 3303 nt3.95□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 TRE2YOR256C 2430 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 OCA4YCR095C 1089 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 HTD2YHR067W 843 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SOL3YHR163W 750 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 ARC15YIL062C 465 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 MMM1YLL006W 1281 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 GAT3YLR013W 426 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 BOS1YLR078C 735 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YLR444CYLR444C 303 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RFM1YOR279C 933 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YPR071WYPR071W 636 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 ICS2YBR157C 768 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 ARO4YBR249C 1113 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RER1YCL001W 567 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 ALG6YOR002W 1635 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 NUP133YKR082W 3474 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 GAT2YMR136W 1683 nt3.94□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YTM1YOR272W 1383 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SPO1YNL012W 1896 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 VAC17YCL063W 1272 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SFG1YOR315W 1041 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 TAF14YPL129W 735 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 OXR1YPL196W 822 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 OM14YBR230C 405 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 MCM2YBL023C 2607 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 GIP4YAL031C 2283 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 TDA6YPR157W 1404 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 HMG1YML075C 3165 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 PST1YDR055W 1335 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SKM1YOL113W 1968 nt3.93□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 OAF1YAL051W 3144 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RDH54YBR073W 2877 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YFL040WYFL040W 1623 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 MIC26YGR235C 702 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 LOH1YJL038C 660 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YUH1YJR099W 711 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SMD3YLR147C 306 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 LIP2YLR239C 987 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 SPC2YML055W 537 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RCL1YOL010W 1104 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 snR189snR189 189 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 NCE102YPR149W 522 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RAD52YML032C 1416 nt3.92□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YGR111WYGR111W 1203 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YAR023CYAR023C 540 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 FAR10YLR238W 1437 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RPP0YLR340W 939 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 ART10YLR392C 1557 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 CCS1YMR038C 750 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RPC34YNR003C 954 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 ATG34YOL083W 1239 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 RPB8YOR224C 441 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 IRC13YOR235W 315 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 FMP30YPL103C 1407 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 TAF12YDR145W 1620 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 YNR066CYNR066C 1311 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 KTR6YPL053C 1341 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 VID28YIL017C 2766 nt3.91□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 MCP2YLR253W 1710 nt3.9□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 NUG1YER006W 1563 nt3.9□□□□□ -1.78
SSK1Q07084 CBS2YDR197W 1170 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SRB5YGR104C 924 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RFA3YJL173C 369 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YJL220WYJL220W 453 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 VPS25YJR102C 609 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 DCS2YOR173W 1062 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 ATG5YPL149W 885 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 VPS69YPR087W 321 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YEH2YLR020C 1617 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 VPS73YGL104C 1461 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YPK9YOR291W 4419 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MEK1YOR351C 1494 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SPB4YFL002C 1821 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 NEM1YHR004C 1341 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 CDC6YJL194W 1542 nt3.9□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 THI7YLR237W 1797 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SPT15YER148W 723 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YAE1YJR067C 426 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YKR070WYKR070W 1059 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YLR156WYLR156W 345 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YLR159WYLR159W 345 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YLR161WYLR161W 345 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 GPN3YLR243W 819 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YNL303WYNL303W 348 nt3.89□□□□□ -1.79
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