Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARDQ03181 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms