Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
TOP2BQ02880 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
TOP2BQ02880 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms