Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms