Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1DQ01668 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms